民航局直屬高校共有4所，分別為中國民航大學、中國民用航空飛行學院、上海民航職業(yè)技術學院、廣州民航職業(yè)技術學院。

中國民航大學簡介：

中國民航大學前身是1951年9月成立的軍委民航局第二民用航空學校，1956年更名為中國人民解放軍第十四航校，1958年更名為中國民用航空高級航空學校，1963年重組為中國民用航空機械專科學校，1977年更名為中國民用航空?？茖W校，1981年更名為中國民用航空學院，2006年5月30日，更名為中國民航大學。

中國民用航空飛行學院簡介：

中國民用航空飛行學院簡稱中飛院（CAFUC），位于四川省廣漢市，是中央部屬高校，由中國民用航空局直屬，入選聯合國重點推廣的“MPL”課程試點單位、四川省“雙一流”建設計劃。是全球辦學規(guī)模最大的飛行培訓機構，是世界上規(guī)模最大的以飛行訓練為主的學校，建校以來，中飛院已為中國民航培養(yǎng)了70%的飛行員、80%的機長、90%的功勛飛行員和100%的特級飛行員，被譽為中國民航飛行員的“搖籃”、中國民航管理干部的“黃埔”。

前身是創(chuàng)建于1956年的中國民用航空局航空學校，同年9月，更名為中國人民解放軍第十四航空學校，后又以中國民用航空高級航校、中國民用航空飛行?？茖W校為校名。1987年11月，升格為本科院校，更名為中國民用航空飛行學院。